培养方向：
指挥类专业主要是为军队培养基层指挥军官，学员毕业后，绝大多数都是分配到各战区、各军种部队的基层单位担任排长、连长、指导员、参谋等职授予中尉军衔。指挥类绝大多数毕业学员会被分配到基层部队担任指挥官(初任职务一般为排长)，主要从事指挥和管理工作，负责部队日常作战、训练和管理等活动的组织实施;少数毕业学员会分配到机关担任各类军事参谋、政治干事、后勤助理员等职务。
非指挥类专业主要为部队培养专业技术军官和文职干部，学员毕业后主要从事教学科研、技术保障等专业技术工作。非指挥类军事院校通常称为专业技术院校，主要为军队培养初级专业技术人员，通常包括军医、军械、军事交通等专业院校，专业技术院校学员学员毕业后，基本上分配到部队医疗机构、科研院所、部队技术保障部门，其人员身份为专业技术军官或军队文职干部。无论哪种院校的毕业生都为军官或干部身份。
说的更加直白一些非指挥类专业就像是地方上企业或者机关里专门从事技术研究的专业。简而言之，指挥类一般培养一线指挥官，非指挥类则侧重培养科研、后勤、技术人才。
未来发展 ：
由于军队的特点和专业性质的不同，也有所不同。一般来说，指挥类院校毕业生到部队后，由于基层军官人员流动较快，如果本人表现出色，容易得到提前晋升的机会，但由于指挥类军官群体呈现金字塔状，越往上升难度越大，淘汰率也越高，很难保证能够在部队长期发展。
专业技术类院校毕业生到部队后，多数从事业务工作，此类人员流动较慢，除非有重大贡献，一般难以有提前晋升的机会，只能按有关规定正常晋升。
但是，根据部队有关规定，专业技术干部的职级晋升可以不受单位级别限制，虽然晋升相对较慢，但在初、中级专业级别范围内，更容易晋升到较高的职务级别，更加稳定。因此，指挥军官初期晋升较快，但晋升的空间有限，而且很难在部队长久发展;
专业技术人员虽然初期晋升较慢，但晋升的空间较大，而且相对在部队发展的时间较长。
报考情况 ：
体检方面，指挥类专业比非指挥类专业要求更严格一些。报考指挥类专业，考生体格检查应为指挥类合格。从报考录取来看，指挥类合格的考生，既可以报考指挥类专业，也可以报考非指挥类专业;体检结果为非指挥类合格的考生，则只能报考非指挥类专业。
录取分数方面，指挥类录取分数相对非指挥类要低一些。